شیر خام بلافاصله بعد از رسیدن به کارخانه به‌وسیله مبدل‌های صفحه‌ای یا لوله‌ای تا دمای ۴درجه سلسیوس سرد می‌شود. پس از انجام مراحل پاستوریزاسیون، مجددا باید دمای شیر تا ۵ درجه سلسیوس کاهش یابد. پس از پر کردن شیر در ظروف و اتمام بسته‌بندی، محصولات در سردخانه بالای صفر با دمای ۵ درجه نگهداری می‌شوند. برخی فکر می‌کنند شیر محلی سالم‌‌تر یا طبیعی‌تر است چون برخی از فرآیندهای پاستوریزه کردن بر روی آن صورت نگرفته است. عده‌ای نیز گمان‌می‌کنند با جوشاندن شیر محلی می‌توانند آن را به شیر پاستوریزه و عاری از باکتری‌های مضر تبدیل کنند. این درحالی‌است که مراحل پاستوریزاسیون کاملا متفاوت است: با جوشاندن، شیر در معرض حرارت مستقیم قرار می‌گیرد اما فرآیند پاستوریزه کردن با دمای کنترل شده و حرارت غیرمستقیم انجام می‌شود. حرارت مستقیم باعث کاهش ارزش غذایی شیر می‌شود و برخلاف باور موجود، مواد مغذی شیر را نیز از بین می‌برد.